پایگاه دانش Reactome: عضویت ژن و مسیر در مسیرهای مرتبط با بیماری

  1. چکیده و مقدمه
  2. SylloBio-NLI
  3. ارزیابی تجربی
  4. کار مرتبط
  5. نتیجه گیری
  6. محدودیت ها و مراجع

الف. رسمی کردن فرآیند تولید منابع SylloBio-NLI

ب. رسمی سازی وظایف 1 و 2

ج. فرهنگ عضویت ژن و مسیر

D. خط لوله مخصوص دامنه برای ایجاد نمونه های NL و دسترسی E به LLM

F. جزئیات تجربی

ز. معیارهای ارزیابی

H. درخواست LLMs – دستورات صفر شات

I. درخواست از LLM – چند اعلان

J. نتایج: دستورالعمل-پاسخ نامناسب

K. نتایج: تأثیر مبهم عوامل حواس پرتی بر استدلال

L. نتایج: مدل‌ها دانش زمینه‌ای را بر دانش زمینه اولویت می‌دهند

M شکل های تکمیلی و N جداول تکمیلی

ج فرهنگ لغت عضویت ژن و مسیر

Reactome[4] (نسخه 88-مارس 2024) دارای ورودی هایی برای 11226 ژن کد کننده پروتئین است که در 15212 واکنش انسانی مشروح شده از 38549 مرجع متون دخیل هستند. این واکنش‌ها به ۲۶۹۸ مسیر جمع‌آوری شده در ۲۹ مسیر فوق‌العاده (مانند سیستم ایمنی) گروه‌بندی می‌شوند که عملکردهای سلولی طبیعی را توصیف می‌کنند. هر ابرمسیر به صورت یک انفجار تقریباً دایره‌ای نشان داده می‌شود که گره مرکزی مربوط به سطح بالای سلسله‌مراتب رویداد Reactome و حلقه‌های متحدالمرکز سطوح ویژه‌ای از سلسله مراتب رویداد را نشان می‌دهد.

Source link